Judai y sus amigos están contando historias de fantasmas. El profesor Banner les cuenta sobre los juegos de los oscuro y un dormitorio abandonado de la academia. Jaden, Syrus, Chumley y Alexis deciden ir al lugar para comprobar la veracidad de la historia. Alexis está en busca de su hermano, quien tiempo atrás había desaparecido en dicho lugar. Al entrar los cuatro, Alexis es capturada por un hombre llamado Titan, Jaden lo enfrenta para salvar a Alexis .titan tiene el rompecabezas del milenio.