Sora desaparece del Campo de Duelo y todo lo que queda son los tres Duelistas: Yuya, Yuto y el misterioso Yugo. Yuto se enfrenta en un Duelo al "agente del lado de la Fusión", Yugo. Sin embargo, Yuto se encuentra constantemente perseguido por Yugo, que es un usuario experto en Sincronías. Yuya trata de detenerlos, pero no lo logra. ¡Un final impactante les espera a todos al final de este Duelo!
